Laboratorium Komputer SMA Santo Petrus memiliki 40 unit komputer PC client yang siap digunakan untuk kegiatan belajar mengajar berbasis komputer. SMA Santo Petrus telah menjadi penyelenggara UNBK Mandiri selama 2 tahun terakhir, yakni tahun 2018 dan 2019. Laboratorium Komputer SMA Santo Petrus juga dilengkapi dengan jaringan internet dan didukung 2 komputer server.