SMA Santo Petrus Ketapang semula bernama SMA Usaba Santo Petrus berdiri pada tanggal 1 April 2005 melalui Surat Keputusan Kepala Dinas Pendidikan Kabupaten Ketapang nomor : 665 Tahun 2005 tanggal 1 April 2005.
SMA Usaba Santo Petrus Ketapang lahir sebagai wujud komitmen Yayasan Usaba untuk terus berkarya dalam bidang pendidikan dalam turut serta mencerdaskan kehidupan bangsa yang telah berkarya selama lebih dari 60 tahun, sekaligus sebagai bentuk kepedulian terhadap masyarakat di Kabupaten Ketapang.
Dalam perkembangan selanjutnya terhitung mulai tanggal 16 September 2011 penyelenggaraan SMA Usaba Santo Petrus telah diserahterimakan dari Yayasan Usaha Baik (Usaba) kepada Yayasan Pelayanan Kasih Fatima, sesuai dengan akta Notaris Yulina Asmara Dewi,SH., Nomor 30 tanggal 16 September 2011.
Sehubungan dengan adanya perubahan yayasan penyelenggara , maka terhitung mulai 1 Juli 2012 nama SMA Usaba Santo Petrus mengalami perubahan menjadi SMA Santo Petrus Ketapang.